首先，牛奶是在小腸中通過乳糖酶分解的，這樣乳糖才能分解成單糖，進入血液；而中國有三分之二以上的成年人小腸中缺乏乳糖酶，缺少乳糖酶的作用，乳糖就直接進入大腸，從而被大腸桿菌等細菌代謝、發酵、產酸產氣，隨后就會出現腹瀉等不適癥狀。

其次，空腹喝牛奶之后，牛奶在胃腸道通過的時間加快，在胃內停留時間變短，排空時間變快，導致吸收效率降低。所以，喝牛奶時應配上固體食物，最好是配上主食，如面包、蛋糕、點心、餅干等。

牛奶中含有豐富的鈣離子，茶葉中含有單寧酸，鈣會與單寧酸反應產生不溶解的鈣鹽，會影響鈣的吸收。

據統計，長期喝茶、飲用咖啡的人群，骨質疏松的概率相對要高一些，這可能與茶、咖啡影響鈣吸收直接相關。

很多人認為高溫消毒，但高溫會使奶中的酪蛋白、乳清蛋白變性；其實，用60℃—70℃的開水沖奶粉，或者把牛奶加熱到60℃—70℃是最合適的。

牛奶也不宜冷凍儲存，因為冷凍會使牛奶中的蛋白質變性，脂肪分層；且解凍后，蛋白質和脂肪沉淀、凝固，既不利于人體吸收，也會使牛奶的價值大大降低。

牛奶里面的蛋白質會影響藥物中的金屬離子結合，影響一些金屬離子在體內發揮作用。